小学4年生のころ、友人の父の会社の参考書のモデルを依頼され、これが女優になるきっかけとなった。
14歳で雑誌のモデルとして正式にデビュー。
漢陽大学校独語独文科在学中に本格的にCMモデルとして、芸能活動を始める。
大学卒業後の1993年、SBSのドラマ「お宅の夫はいかがですか」で女優としてデビュー。
このドラマは高く評価され、1994年のSBS演技大賞で新人賞を受賞した。
映画・ドラマへの出演を続けながら中央大学校新聞放送大学院演劇映画科を修了。
2000年、映画「JSA」の公開で日本でも知られるようになる。
2005年10月、日本で主演ドラマ「宮廷女官チャングムの誓い」がNHK総合テレビで放送され、イ・ヨンエの人気を不動のものとする。
2007年1月から2008年2月まで「宮廷女官チャングムの誓い<完全版>」がNHKBS2にて放送。
2007年8月11日、東京ドームにて「宮廷女官チャングムの誓い FESTIVAL in TokyoDome」が開催され、出演。
現在はドラマ、映画等の仕事からは一線をひいているが、TVCMに出演することがある。